🩠 ✂ đŸ“± Le nouveau test COVID-19 basĂ© sur le CRISPR utilise les camĂ©ras des smartphones pour repĂ©rer l’ARN du virus

« Dans le test de diagnostic, un Ă©chantillon de patient est mĂ©langĂ© avec les protĂ©ines CRISPR Cas13 (en violet) et des sondes molĂ©culaires (en vert) qui deviennent fluorescentes, ou s’allument, lorsqu’elles sont coupĂ©es. Lorsque l’ARN du coronavirus est prĂ©sent dans l’Ă©chantillon, il incite les protĂ©ines CRISPR Ă  couper les sondes molĂ©culaires, ce qui fait que tout l’Ă©chantillon Ă©met de la lumiĂšre. Cette fluorescence peut ĂȘtre dĂ©tectĂ©e Ă  l’aide d’un appareil photo de tĂ©lĂ©phone portable », rapporte Berkeley.edu.

Les scientifiques des instituts UC Berkeley et Gladstone ont mis au point un nouveau test de diagnostic COVID-19 basĂ© sur le CRISPR qui, Ă  l’aide d’une camĂ©ra de smartphone, peut fournir un rĂ©sultat positif ou nĂ©gatif en 15 Ă  30 minutes. Contrairement Ă  de nombreux autres tests disponibles, ce test donne Ă©galement une estimation de la charge virale, ou du nombre de particules virales dans un Ă©chantillon, ce qui peut aider les mĂ©decins Ă  suivre la progression d’une infection COVID-19 et Ă  estimer le degrĂ© de contagion d’un patient.

« Le suivi de l’Ă©volution de l’infection d’un patient pourrait aider les professionnels de la santĂ© Ă  estimer le stade de l’infection et Ă  prĂ©dire, en temps rĂ©el, le temps nĂ©cessaire Ă  la guĂ©rison et la durĂ©e de la quarantaine », a dĂ©clarĂ© Daniel Fletcher, professeur de bio-ingĂ©nierie Ă  Berkeley et l’un des responsables de l’Ă©tude.

Une photo montre une boĂźte noire, de la taille d’un petit pain, sur laquelle est posĂ© un iPhone. Le test de diagnostic nĂ©cessite un appareil photo de tĂ©lĂ©phone portable et un petit appareil portatif. (Photo reproduite avec l’aimable autorisation de Daniel Fletcher)

La technique a Ă©tĂ© conçue en collaboration avec le Dr Melanie Ott, directrice de l’Institut de virologie de Gladstone, ainsi qu’avec Jennifer Doudna, professeur Ă  Berkeley, qui est chercheuse principale Ă  Gladstone, prĂ©sidente de l’Institut de gĂ©nomique innovante et chercheuse Ă  l’Institut mĂ©dical Howard Hughes. Mme Doudna a rĂ©cemment reçu le prix Nobel de chimie 2020 pour avoir co-dĂ©couvert la technologie d’Ă©dition du gĂ©nome CRISPR-Cas, qui sous-tend ces travaux.

La plupart des tests de diagnostic COVID-19 reposent sur une mĂ©thode appelĂ©e PCR, abrĂ©viation de « polymerase chain reaction« , qui recherche des morceaux de l’ARN viral du SRAS-CoV-2 dans un Ă©chantillon. Ces tests PCR fonctionnent en isolant d’abord l’ARN viral, puis en convertissant l’ARN en ADN et en « amplifiant » ensuite les segments d’ADN – en faisant de nombreuses copies identiques – afin que les segments puissent ĂȘtre dĂ©tectĂ©s plus facilement.

Le nouveau test de diagnostic tire parti de la protĂ©ine CRISPR Cas13, qui se lie directement aux segments d’ARN et les clive. Cela Ă©limine les Ă©tapes de conversion et d’amplification de l’ADN et rĂ©duit considĂ©rablement le temps nĂ©cessaire pour effectuer l’analyse.

« L’une des raisons pour lesquelles nous sommes enthousiasmĂ©s par les diagnostics basĂ©s sur CRISPR est la possibilitĂ© d’obtenir des rĂ©sultats rapides et prĂ©cis au moment oĂč l’on en a besoin », a dĂ©clarĂ© M. Doudna. « Cela est particuliĂšrement utile dans les endroits oĂč l’accĂšs aux tests est limitĂ© ou lorsque des tests frĂ©quents et rapides sont nĂ©cessaires. Cela pourrait Ă©liminer une grande partie des goulots d’Ă©tranglement que nous avons constatĂ©s avec COVID-19 ».

Dans le test, les protĂ©ines CRISPR Cas13 sont « programmĂ©es » pour reconnaĂźtre des segments de l’ARN viral du SRAS-CoV-2, puis combinĂ©es avec une sonde qui devient fluorescente lorsqu’elle est clivĂ©e. Lorsque les protĂ©ines Cas13 sont activĂ©es par l’ARN viral, elles commencent Ă  cliver la sonde fluorescente. À l’aide d’un appareil portatif, la fluorescence rĂ©sultante peut ĂȘtre mesurĂ©e par la camĂ©ra du smartphone. La vitesse Ă  laquelle la fluorescence devient plus brillante est liĂ©e au nombre de particules virales dans l’Ă©chantillon.

« Les modĂšles rĂ©cents du SRAS-CoV-2 suggĂšrent que des tests frĂ©quents avec un dĂ©lai d’exĂ©cution rapide sont ce dont nous avons besoin pour surmonter la pandĂ©mie actuelle », a dĂ©clarĂ© M. Ott. « Nous espĂ©rons qu’avec une augmentation des tests, nous pourrons commencer Ă  rouvrir les Ă©conomies et Ă  protĂ©ger les populations les plus vulnĂ©rables ».

Maintenant que le test basĂ© sur CRISPR a Ă©tĂ© dĂ©veloppĂ© pour le SRAS-CoV-2, il pourrait ĂȘtre modifiĂ© pour dĂ©tecter les segments d’ARN d’autres maladies virales, comme le rhume, la grippe ou mĂȘme le virus de l’immunodĂ©ficience humaine. L’Ă©quipe travaille actuellement Ă  la mise au point d’un dispositif qui pourrait ĂȘtre mis Ă  disposition dans les cliniques et autres lieux de soins et qui pourrait mĂȘme ĂȘtre utilisĂ© un jour Ă  domicile.

« L’objectif final est de disposer d’un appareil personnel, comme un tĂ©lĂ©phone portable, capable de dĂ©tecter toute une sĂ©rie d’infections virales diffĂ©rentes et de dĂ©terminer rapidement si vous avez un rhume, le SRAS-Cov-2 ou la grippe », a dĂ©clarĂ© M. Fletcher. « Cette possibilitĂ© existe maintenant, et une collaboration plus poussĂ©e entre les ingĂ©nieurs, les biologistes et les cliniciens est nĂ©cessaire pour que cela devienne une rĂ©alité ».

Laisser un commentaire

Ce site utilise Akismet pour réduire les indésirables. En savoir plus sur comment les données de vos commentaires sont utilisées.